Pour certaines applications, un traitement biologique appelé SBR (Single Batch Reactor) peut être proposé.

Dans cette configuration, l'activation biologique et la séparation liquide/solide se font dans le même bassin. Celui-ci fonctionne en cycle alterné avec des périodes où il est aéré et sert de réacteur biologique et d'autres périodes durant lesquelles l'aération est arrêtée autorisant ainsi la décantation.